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一、脱毒种薯的收获 脱毒种薯要适时收获，一般以10月下旬、日平均气温在15℃左右时收获为宜。如果收获期过晚，脱毒种薯在田间受冻，其抗病能力差，贮藏前期易腐烂。应选择晴暖天气，于上午刨收种薯晾晒，当天下午入窖；如当天不能入窖，须堆起覆盖过夜，以防种薯受冻。收获时要做到轻刨、轻装、轻运、轻卸，尽量减少种薯破损。入窖时要严把质量关，把有损伤、病虫、龟裂和重量小于100克及不符合本品种特征特性的种薯剔除出来。
二、贮藏窖的准备 选择避风向阳，地势高燥，土质坚实，地下水位低，运输管理方便，排水条件良好的地方建窖。若用旧窖贮藏，必须彻底打扫消毒，消毒方法是：用铲刮去窖内一层表土，然后用生石灰、福尔马林液、多菌灵液喷洒或硫磺熏蒸消毒。种薯进窖前，须在地面及四周铺上一层玉米秸秆，不仅可减少种薯破损，而且可吸收多余水分。
三、种薯窖的管理 种薯入窖后1~20天为贮藏前期，由于此期气温较高，种薯呼吸作用强，排出的水分多，湿度大，窖温易升高，应注意及时打开门窗和通气孔进行降温散湿。待窖温降至13~15℃时，要立即关闭门窗，调节通气孔，防窖温急剧下降。从种薯入窖20天后至第二年2月上旬为贮藏中期，此期气温低，种薯易受冻害，因此除了要关闭好门窗和通气孔外，还要在门窗外加防寒棉帘或在种薯上加盖保湿草苫，使窖内温度保持在11~13℃之间。2月中旬以后为贮藏后期，此期气温、地温虽回升快，但往往寒流较多，气温不稳定，而经过长期贮藏的种薯生理机能又较差，尤其对低温较敏感。因此后期应以稳定窖温为主，使窖温保持在13~14℃的范围内。总之，种薯贮藏期内窖温不能低于9℃，低了种薯易受冻害；不能高于15℃，高了种薯会发芽，并易发生甘薯软腐病，降低种薯的出窖率。窖内湿度维持在75%~85%之间。贮藏期如发现病烂薯，应及时清理出窖，并在坏烂薯处洒些粉状杀菌剂或生石灰进行消毒，以防病害蔓延；若病烂薯较多，可轻翻薯堆取出烂薯，切记不可倒窖。
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